La Ley consta de 11 títulos y 73 artículos. INDICE: Objeto, autoridad de aplicación y definiciones básicas (I); Salud animal y salud vegetal: diagnostico, vigilancia y dispositivo nacional de emergencia (II); Inspección de los productos y subproductos de origen animal y vegetal (III); Programas y campañas de prevención, control y erradicación de plagas y enfermedades sanitarias y fitosanitarias (IV); Cuarentena agropecuaria (V); Registro y control de los insumos y productos para uso agropecuario, acuicola, pesquero, forestal y agroforestal (VI); Acreditación de personas naturales y jurídicas para programas sanitarios y fitosanitarios, y la coordinación nacional e internacional (VII); Obligaciones de las personas naturales y jurídicas (VIII); Infracciones y sanciones (IX); Recursos económicos (X); Disposiciones transitorias y finales (XI).
La presente Ley tiene por objeto establecer las disposiciones fundamentales para la protección de la salud y conservación de los animales, vegetales, sus productos y subproductos contra la acción perjudicial de las plagas y enfermedades de importancia económica, cuarentenaria y social en armonía con la defensa de la actividad agropecuaria sostenida, de la salud humana, los recursos humanos, biodiversidad y del ambiente (art. 1º). Para cumplir con el desempeño de sus funciones el Ministerio de Agricultura y Ganadería, que es la autoridad de aplicación de la presente Ley, creará: a) la Dirección de Salud Animal y la de Sanidad Vegetal con el objeto de velar por la salud de los animales, vegetales, por la inocuidad de los productos y subproductos de éstos, contra la acción perjudicial de las plagas y enfermedades con la finalidad de proteger la salud humana y el patrimonio agropecuario nacional (art. 4º); y b) el Registro Nacional relacionado con los productos veterinarios de origen químico-biológico, radiactivos y los alimentos para los animales, así como aquellos insumos agropecuarios que no estén comprendidos en el Registro Nacional de Plaguicidas, Sustancias Tóxicas, Peligrosas y otras similares (creado por la Ley Nº 274 de 1997), y con el origen genealógico del ganado (arts. 3º y 37). Asimismo, se crean la Dirección General de Protección y Sanidad Agropecuaria (DGPSA) como instancia de coordinación, elaboración, ejecución y consulta de los programas, subprogramas y políticas del Ministerio de Agricultura y Ganadería (art. 5º), y la Comisión Nacional de Sanidad Agropecuaria (CONASA) con el objetivo de fortalecer la coordinación, cooperación y asesoramiento de las actividades a realizar por parte de la DGPSA (art. 6º). Corresponde al Ministerio de Agricultura y Ganadería declarar el estado de alerta sanitaria y fitosanitaria y coordinar el Dispositivo nacional de emergencia en salud animal y sanidad vegetal (arts. 14 y 15). Corresponde a la DGPSA, por medio de la Dirección de Salud Animal, normar, coordinar, facilitar y ejecutar la inspección oficial sanitaria en materia de salud animal(art. 17) y, por medio de la Dirección de Salud Vegetal, normar, coordinar, facilitar y ejecutar la inspección oficial sanitaria en materia de sanidad vegetal (art. 23).